软式光纤内窥镜孔探仪使用两组光纤光束（Fiberoptic Optical Bundle），分别图像光纤光束和照明光纤光束，共同设置在一个可弯曲的伸入软管中。对于一般的软式光纤内视镜，主要的组成部分包括插入部分（含前端部分、弯曲部分和柔软部分）、控制部分和目镜。此外，图像传导纤维、光导纤维和检测角度控制绞线也都安装在伸入软管内。

由软式光纤内窥镜孔探仪末端的物镜（Objective Lens）所捕捉到的受检物体图像，将不象刚性内视镜那样由一系列透镜传送，而是由一个特别的光纤束（称为图像束（Image Bundle））传回到目镜（Eye piece），供检查者进行观测之用。

软式光纤内视镜主要是利用高品质玻璃纤维束来提供图像传输功能，图像分辨率的好坏取决于光纤的品质。由于软式光纤内窥镜孔探仪的镜体柔软且可弯曲，因此可以容易地通过导管伸入到不易接近的拐角部位，进行检测工作。其应用要比刚性内视镜更灵活。例如，在检测发动机中高温、高压的涡轮叶片时，可以将软式光纤内视镜通过燃烧筒的检查孔导入，从而完成检查，而刚性内视镜则无法完成这类任务。目前各国使用的软式光纤内视镜的直径范围在0.6~13.5毫米之间，工作长度（Working Length）在1~6米不等。

近年来随着光学技术的发展，软式光纤内视镜已经开始使用高密度玻璃纤维束，可提供非常明亮、清晰的图像。同时，这种内窥镜孔探仪的检测镜头，除了可以像刚性内视镜那样根据需要更换合适角度的镜头外，还可利用控制器来（朝2个或4个方向）调整弯曲段末端的角度（最大可达120度）。另外，国外最新型的软式光纤内视镜采用了锥形镜管（Tapered Flex），能够插入多重弯曲的管路中，使检测工作更加方便。